复旦大学附属儿科医院本着公平、公开、公正的原则,对复旦大学附属儿科医院Alamut Visual软件升级及许可证采购项目进行公告。
一、项目主要建设内容:
分子医学中心拟在2020年已采购Alamut Visual软件(由Sophia Genetics公司提供)的基础上,对软件进行升级(升级后为Alamut Visua Plus)并续约一年的软件使用授权许可证,以用于协助基因诊断过程中的变异分析。
该软件在基因组学研究领域被广泛认可,能够提供实时、精确、广泛的遗传变异注释信息,辅助遗传咨询人员对遗传变异的功能进行更准确的解读,提升分析和筛选遗传变异的效率。
软件采取授权码在线认证方式进行使用授权,不限安装次数。授权费用根据可允许同时使用的最大用户数而不同。经过权衡,分子医学中心拟续约最多允许三名用户同时使用的授权码,授权有效期一年,为自2020年采购后的续约。该授权包括了有效期内的数据库访问和更新、软件升级和维保,以及Alamut Visual软件的功能升级,相比原版主要增加功能包括:
1. 增加了Extranet界面,Extranet为Alamut Visual Plus的管理器,可以添加管理Alamut Visual Plus用户,查看License激活情况、License细节如到期时间等。
2. 界面更新,相对原版采用了更为人性化及美观的界面。将所有人类突变相关的频率数据库整合到一个Track中(包含新增的1000 Genomes和Danish2K,以及原有的dbSNP,gnomAD,ESP,GoNL,HGVD)。
3. 新增Genomic Views页面,可视化所有染色体包括线粒体染色体。
4. 新增结构变异的注释Track注释,通过DGV数据库展示了基因组中的结构变异。DGV(Database of Genomics Variant)提供了一个人类基因组结构变异(Structural Variation)的综合总结,其中定义结构变异为涉及DNA片段超过50bp的基因组改改变,数据库内容只展示在健康样本中识别的结构变异。
5. 新增Repeat Masker的注释Track,展示重复DNA区域。通过DGV数据库展示了基因组中的结构变异。DGV(Database of Genomics Variant)提供了一个人类基因组结构变异(Structural Variation)的综合总结,其中定义结构变异为涉及DNA片段超过50bp的基因组改改变,数据库内容只展示在健康样本中识别的结构变异。
6. 新增ACMG-AMP变异解读指南。美国医学遗传学与基因组学学会(American College of Medical Genetics and Genomics, ACMG)在一篇2015的报告中,提供了在临床语义中,针对遗传疾病的序列变异的报告和解读。用户可以基于科学语境调整变异证据。选择的证据接着会展示在变异面板中。建议的ACMG致病分类由用户选择的证据评估。
7. 优化变异注释页面,将不同Track的注释都整合到这个页面中来,预测功能和自建变异信息也整合在此界面中。
8. 优化报告导出功能,美化了固定模板,导出变异报告时可自定义导出字段。
9. 新增Sanger电泳图谱功能,支持上传Sanger电泳图谱(Sanger Electropherogram)数据。
10. 新增API功能,外部工具可以通过API控制软件。
二、本次采购要求:
1、 项目工期:合同签署后的7天内完成。
2、 项目最高采购限价:4.5万元人民币,高于最高采购限价将予以否决。
3、 售后服务要求
维保期限:免费提供1年软件的质保服务,质保期自验收合格,双方签字的次日起算。
故障响应:应提供7*24小时应急服务,在接到报修通知后,应在10分钟内响应,2小时内赶到现场,查找原因,提出解决方案,修复时间应不超过1个工作日。
三、对响应人资格要求:
1. 响应人必须是在中华人民共和国境内注册、具有独立法人资格的单位,须提供加盖公章的工商营业执照复印件;
2. 本次采购不接受联合体响应。
四、响应文件:
1、 响应文件内容:
(1)公司营业执照,相关资质证明文件,加盖单位公章;
(2)本项目报价方案、软件功能列表、维保承诺、故障响应承诺,加盖单位公章;
(3)公司相关案例等,加盖单位公章;
(4)关于近三年无行贿犯罪情况的书面声明(见附件,自行下载),加盖单位公章。如不是法人签名,代理人签名需附授权文件。
2、响应文件递交:
(1)递交截止时间:2021年8月2日17点整
(2)递交地点:闵行区万源路399号复旦大学附属儿科医院信息网络管理中心
(3)递交方式:以打印文件形式提供,并密封加盖骑缝章包装
六.联系方式:
联系人:邹老师
联系电话:021-64931983
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