儿科医院心血管专业是卫生部重点学科，也是医院传统的优势专业。中心下辖心外科、心内科、心超室、心电图室、专科门诊五个部门。中心党支部共有党员26名，其中担任校级领导一名，院级领导两名。支部长期以来将党务工作与行政工作紧密配合，为科室发展保驾护航。当科室发展出现棘手的问题时，通过党内外民主座谈会，支部会把来自基层的意见和建议转达给医院、科室领导；当青年医护人员出现情绪波动时，分散在各部门的支委会在第一时间为他们解疑释惑，做好他们的思想工作；当有重大政治任务时，支部广大党员尤其是青年党员会主动承担，西部下乡医疗支援、远赴新疆为维族先心病患儿诊断筛查等多项艰苦的医疗任务均由党员同志担纲完成。支部不断探索组织生活的新形式，致力于提高组织生活质量。支部积极参与医院、科室的对外宣传及拓展，并以党员同志为中坚力量，与社会组织、团体合作开展多种模式的慈善公益活动。支部在日常工作中注重党建带动团建，使广大青年骨干团结在党组织周围，努力成为党需要的优秀科技人才在科室青年医护人员中蔚然成风。支部近年来有多人次获得院级、校级、市级及国家级奖项。2011年支部荣获儿科医院优秀党支部及复旦大学先进基层党组织。