国家儿童医学中心消化专科联盟2019年由复旦大学附属儿科医院牵头，联合首都医科大学附属北京儿童医院和上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心共同成立，复旦儿科医院黄瑛教授担任主任委员；现有成员单位72家，已覆盖全国29个省（区、市）。

　　2021年，联盟积极开展医护人员培训，先后举办“第三届儿童炎症性肠病国际高峰论坛”、“第十三届儿童消化及内镜诊治技术新进展学习班”、“儿童炎症性肠病MDT学术研讨会”等5场高水平学术活动，培训学员近百名，介绍儿童消化性疾病国际前沿诊治知识；做深做广多中心临床研究，持续推进“中国儿童幽门螺杆菌一线治疗方案疗效评估和耐药率研究、对患儿菌群的长期影响”和“儿童结肠镜检查前不同肠道准备方案比较的研究”，已在《Helicobacter》等国际知名杂志上发表数篇论文；在权威期刊发表《麻醉状态下儿童择期结肠镜检查肠道准备专家共识》、《Recommendations regarding the admission, infection prevention and control of pediatric patients during coronavirus disease 2019 outbreak in Shanghai China》、《抗肿瘤坏死因子-α制剂治疗儿童克罗恩病的专家共识》3部专家共识，助力疾病标准化治疗方式推广；牵头新建“极早发炎症性肠病临床表型及基因检测数据库”，已纳入近150例VEOIBD患者临床及分子诊断数据，为开辟儿童极早发炎症性肠病治疗新方法奠定了重要基础；积极开展科普宣传，推送科普文章100余篇，为31.9万人次带来了国家级健康知识宣教。
　　今后，国家儿童医学中心消化专科联盟将更有效地统筹、引导、整合儿童消化病专科医疗资源，发挥优势学科示范引领作用，促进联盟成员单位交流合作，优化儿童消化系统慢性疾病规范管理，持续提高医护人员诊治能力，实现信息互通、优势互补、资源共享，满足儿童日益增长的医疗需求。