2017年9月，中国援助阿富汗先心病患儿来中国治疗，筛选约21名患者到新疆。上海儿童医学中心心胸外科主任张海波教授被委派为专家组组长主持该项工作，与安贞医院、八一儿童医院等专家共开展了15台小儿心脏外科手术。这些援外项目充分展示了中国医疗技术水平和国际人道主义，同时加深了我国同各国人民的友谊。中国红十字总会陈竺会长专门致函医院：“你们为国家人道事业做出了重要贡献，为中阿人民友谊作出了重要贡献，同时也对卫生援疆做出了特殊贡献，体现了国家儿童医学中心的人道精神和高超医技，谨向你们表示感谢和致意！”随着上海儿童医学中心国际影响力的不断提升，近年来应加蓬共和国、塞尔维亚共和国、孟加拉国、摩洛哥王国等卫生部邀请，多次派出高级专业人才，开展“加-中小儿外科合作”项目、“塞-中儿童先心病救治合作”项目和“孟-中小儿先心外科合作”项目等，其中大动脉转位手术、全腔肺静脉与肺动脉连接术、二期“法四”根治术等手术开启孟加拉国此类手术的先例。