复旦大学附属儿科医院营养室成立于1952年，2015年7月更名临床营养科。负责全院临床营养筛评诊治一体化管理，全院营养查房、营养会诊和营养门诊工作；提供疑难、罕见、危重及大手术病人的膳食、肠内和肠外营养诊疗；同时为全院近1000张床位提供普通膳食、治疗膳食和肠内营养供应。是国家卫健委健康管理研究所颁发的临床营养示范单位，全国儿童营养标准与规范培训基地，上海市相关医学院校临床营养专业教学实习单位之一。 2013年起全院开展住院患儿营养风险筛查，成立院级营养支持小组。目前已形成一套完整流畅的医院营养筛查、评估、诊断和治疗一体化流程，解决住院患儿营养治疗相关问题（膳食、经口营养补充、肠内营养和肠外营养）。开设临床营养门诊（每周6个半天），参与MDT诊疗（22个），并参与厦门分院、海南分院和安徽儿童医院等医联体单位相关临床营养诊疗服务。目前制定针对多学科综合诊疗、FSMP合理化应用和营养筛查、评估、治疗一体化的院级规章制度，有相应工作委员会和日常工作内容。