昆山市与复旦大学附属儿科医院的合作源远流长，深度和广度不断拓展：2011年昆山市妇幼保健所加入复旦儿科全国先心病筛查协作网；2013年昆山市第一人民医院成为儿科医院协作单位；2017年昆山市卫生计生委与儿科医院签署战略合作框架协议。在前期良好合作基础上，昆山市政府决定组建苏州地区第一家妇幼保健院，委托复旦大学附属儿科医院全面托管，以满足昆山市及周边地区对高质量妇幼健康服务的需求。这是昆山主动接轨上海、融入长三角、落实长三角一体化发展国家战略的重要举措。
黄国英院长指出，复旦大学附属儿科医院作为国家儿童医学中心，始终致力于推动建立儿科命运共同体；昆山市妇幼保健院作为新成立的医疗机构，本次合作对于昆山市妇幼健康事业的发展有着里程碑意义。复旦大学附属儿科医院将充分发挥技术辐射引领作用，以丰富的管理经验为昆山妇幼健康特别是儿童医疗卫生事业贡献力量。
昆山市妇幼保健院将按照三级妇幼保健院标准建设，规划床位600张，在整合昆山市第一人民医院和昆山市妇幼保健所的妇幼医疗和妇幼健康服务相关职能的基础上独立设置；负责全市妇幼保健工作，开展与妇女儿童相关的临床医疗服务，提供产科和儿科（新生儿科）住院服务。